About Sébastien
A professional in Computer Science, with an expertise in the field of Artificial Intelligence, I have 17 years of experience principally in the in vitro diagnostic industry, developing new medical tools and devices in order to improve Healthcare.
Key strengths, competencies and skills:
• Computer Science
- Artificial Intelligence: Machine Learning, Deep Learning and Multi-Agent Systems.
- Scientific Computing: Numerical Simulation and Parallel Computing (Multicore CPU, GPU).
- Virtual Reality: Multi-agent simulations, E-learning and Virtual Training.
- Language Programming: C, C++, C#, Java and Python.
+ Machine Learning Frameworks: scikit-learn, TensorFlow.
• R&D Project Management
- (Sub)Contracting
- Supervision
- Reporting
• Team-Leading
- Managing Junior/Senior Engineers, PhD Students and Trainee Engineers in Biological and Computer Sciences.
• Scientific Research and Innovation
- Inventor of International Patents
- Author of International Publications
• Cross-disciplinary Accomplishments
- Bridging the gap between Biological and Computer Sciences
+ Collaborating with biological scientists: internationally renowned researchers or close collaborators.
+ Designed and led one biomedical research.
+ Developed and patented a universal enzymatic assay to measure anticoagulant level in a blood sample (as the only inventor).
Spanish
Fluent
English
Fluent
French
Native or bilingual
Can work on-site
Paris (up to 50km), Paris (up to 100km), Nantes (up to 100km), Rennes (up to 100km), Toulouse (up to 100km)
Experience
- Diagnostica StagoResponsable d'études R&DMEDICALJanuary 2016 - August 2019 (3 years and 8 months)Gennevilliers, FranceMise en place et management d’une équipe de recherche et développement spécialisée en Intelligence Artificielle.• Gestion de base de données biologiques et cliniques- Anonymisation, pseudonymisation des données de santé.- Automatisation de la récupération des données.- Stockage des données sur une plateforme PostgreSQL.• Post-traitement (rendu de résultats biologiques) par Intelligence Artificielle de tests biologiques (tests d’hémostase)- Détection de valeurs aberrantes sur des mesures expérimentales post-traitées par des modèles de détection d’anomalies.- Calcul du résultat biologique de tests d’hémostase post-traités par des modèles d'apprentissage automatique (classification et régression) : SVM, KNN, Random Forest, MLP, CNN et RNN.• Développement d’Intelligences Artificielles pour l’aide à la prise de décision(s) clinique(s)- Diagnostic de la présence, du type et de la sévérité d’une hémophilie.- Individualisation de thérapie(s) pour la prise en charge personnalisée du patient hémophile :+ Modèles génératifs profonds : Deep Autoencoders, GAN.- Modèles de détection d'anomalies pour l'exclusion du risque de récidive(s) d’évènements thrombotiques.• Calcul distribué- Conception, implémentation et déploiement d’algorithmes pour la parallélisation de l’entraînement des modèles d’apprentissage automatique+ Répartition des traitements et opérations sur différentes unités de calculs (CPU multi-cœur, GPU).• Environnement technique- OS : Unix/Linux, MacOS et Windows- Base de données PostgreSQL- Langages de programmation : Python 2.7 et 3.6+ Machine Learning Frameworks: scikit-learn, TensorFlow.• Gestion de projets- Supervision (planning, budget, restitution de l’avancement, dossiers CIFRE et CIR)+ Kanban- Gestion de la sous-traitance (contractualisation, suivi)- Gestion des collaborations industrielles et académiques (aspects scientifiques et contractuels)- Interdisciplinarité : Intelligence Artificielle, Recherche Clinique et Biologie.
- Diagnostica StagoResponsable de service R&DMEDICALOctober 2014 - December 2015 (1 year and 3 months)Gennevilliers, FranceManagement d’un service de recherche et développement, spécialisé en Simulation Numérique, Réalité Virtuelle et Intelligence Artificielle.• Modélisation et simulation numérique du phénomène de la coagulation du sang- Invention d’un test enzymatique pour le dosage universel d’anticoagulants+ Preuve de concept++ Modélisation mathématique et simulation numérique in silico++ Validation expérimentale in vitro+ Dépôt de brevet- Algorithme de post-traitement (rendu du résultat biologique) d’un test global d’hémostase décliné sur un système Point-of-Care+ Conception de l’algorithme par modélisation mathématique+ Implémentation et intégration de l’algorithme au logiciel du système• E-learning- Création de contenus numériques pour la formation à l’utilisation de matériel de laboratoire en hémostase.• Environnement technique- Systèmes d’exploitation : Unix/Linux, Windows.- Langages de programmation : C, C++ et C#.• Gestion de projets- Supervision (planning, budget, restitution de l’avancement, dossiers CIR)- Interdisciplinarité : Simulation Numérique, Formation et Biologie.
- Diagnostica StagoResponsable de service R&DMEDICALJanuary 2012 - December 2013 (2 years)Gennevilliers, FranceMise en place et management d’un service de recherche et développement, spécialisé en Simulation Numérique, Réalité Virtuelle et Intelligence Artificielle.• Modélisation et simulation numérique du phénomène de la coagulation du sang- Recherche biomédicale HémoTIV : démontrer la possibilité de simuler in silico des tests in vitro mesurés sur 95 patients et 10 sujets sains.+ Construction du dossier++ Protocoles expérimentaux++ Comité de protection des personnes+ Etude expérimentale++ Collecte des échantillons++ Mesures in vitro++ Modélisations et simulations in silico- Modélisation 3D et simulation numérique de l’hémostase au sein d’un vaisseau sanguin virtuel+ Modélisation du flux sanguin : équations de Navier-Stokes+ Modélisation de la coagulation plasmatique : équations d’advection-diffusion-réaction+ Modélisation des cellules : système multi-agents+ Résolution numérique : distribution des calculs sur CPU multi-cœur et GPU.• Environnements virtuels de formation- Développement d’un système de Réalité Virtuelle pour la formation à l’utilisation de matériel de laboratoire en hémostase.• Modélisation 3D d’instruments d’hémostase- Simulation numérique de différentes stratégies d’ordonnancement dans le but d’optimiser la cadence des instruments de mesure.• Environnement technique- Système d’exploitation : Unix/Linux.- Langages de programmation : C et C++.+ API : CUDA, GNU Scientific Library, OpenGL.• Gestion de projets- Supervision (planning, budget, restitution de l’avancement, dossiers CIFRE, dossiers CIR)- Gestion de la sous-traitance (contractualisation, suivi)- Gestion des collaborations industrielles et académiques (aspects scientifiques et contractuels)- Communication : publications scientifiques, présentations lors de congrès scientifiques internationaux.- Interdisciplinarité : Calcul Scientifique, Réalité Virtuelle, Formation et Biologie.
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Education
- Diplôme d'ingénieur en informatique industrielleEcole Nationale d'Ingénieurs de Brest2001Formation généraliste à dominante informatique industrielle.
- Thèse de doctorat en informatiqueUniversité de Rennes I2006Modélisation et simulation informatique de la coagulation du sang.