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Marion CrespoMC

Marion Crespo

Bio-informaticienne multi-omique

€250/day
Grenoble, FR
3-7 years

Average response time: 1 hour

About Marion

Je suis ingénieur en Chimie avec une spécialisation en Sciences de la vie. Passionnée par les analyses à large échelle, j'ai réalisé mon doctorat en analyse de données multi-omiques.

Je suis capable de réaliser des projets d'analyse de données de protéomique, métabolomique, transcriptomique et génomique ou de muti-omique. Je dispose d'une forte expérience en analyse MS, ChIP-seq et RNA-seq et d'un solide background en épigénétique et épigénomique.

A partir de vos données brutes, je peux donner du sens à vos résultats en utilisant les pipelines d'analyse que j'ai mis en place puis en corrélant les résultats avec R, Bash ou Python. Je reste à votre disposition pour de plus amples informations. Je serais ravie de vous aider à comprendre les mécanismes biologiques au coeur des vos thématiques d'intérêt par une approche multi-omique.
  • French

    Native or bilingual

Can work on-site
Grenoble (up to 10km), Lyon (up to 10km)

Experience

  • CEA
    Analyse de données multi-omiques
    BIOTECH
    October 2016 - December 2019 (3 years and 3 months)
    Grenoble, France
    Proteomic analysis of histone post-translational modifications (focus on acetylation and crotonylation) during mouse spermatogenesis
    Metabolomic analyses of acyl-CoA (substrates of acylations) in mouse testis cells
    Genomic analysis (ChIP-seq) of crotonylation in spermatocytes and round spermatids
    - Implementation of bioinformatics pipelines for quality control, mapping and peak calling of ChIP-seq datasets: Fastqc, Seqtk, Trimmomatic, Bowtie2, Picard tool, Macs2 – Bash programming
    - Writing of R scripts and usage of bedtools commands in Unix for genomics data analysis
    - Integration with public ChIP-seq data such as H3K4me1 for enhancers, H3K4me3 for active transcription and transcription factors or regulators
    Transcriptomic analysis of RNA expression in spermatocytes and round spermatids
    Programming with Bash, R and Python (3 years)
    Biostatistical analysis of genomic and transcriptomic data
    Three projects realized in collaboration with research teams

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Education

  • Doctorat en analyse de données multi-omiques
    CEA Grenoble
    2020
  • Mastère Spécialisé Management des Entreprises de Biotechnologies & Pharmacie
    Grenoble Ecole de Management
    2020

Certifications

  • Formation en R avancé
    Université Grenoble Alpes
    2018

Skill set (12)

Categories