Marion Crespo

Multi-omic data scientist

Remote from Grenoble

  • 45.1868
  • 5.7262
  • Indicative rate €300 / day
  • Experience 2-7 years
  • Response rate 100%
  • Response time 1h
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Location and geographical scope

Location
Grenoble, France
Remote only
Works remotely most of the time

Preferences

Project length
  • ≤ 1 week
  • ≤ 1 month
  • Between 1-3 months
  • Between 3-6 months
  • ≥ 6 months

Verifications

Languages

  • Anglais

    Full professional proficiency

  • Espagnol

    Full professional proficiency

Categories

Skills (12)

Marion in a few words

Je suis ingénieur en Chimie avec une spécialisation en Sciences de la vie. Passionnée par les analyses à large échelle, j'ai réalisé mon doctorat en analyse de données multi-omiques.

Je suis capable de réaliser des projets d'analyse de données de protéomique, métabolomique, transcriptomique et génomique ou de muti-omique. Je dispose d'une forte expérience en analyse MS, ChIP-seq et RNA-seq et d'un solide background en épigénétique et épigénomique.

A partir de vos données brutes, je peux donner du sens à vos résultats en utilisant les pipelines d'analyse que j'ai mis en place puis en corrélant les résultats avec R, Bash ou Python. Je reste à votre disposition pour de plus amples informations. Je serais ravie de vous aider à comprendre les mécanismes biologiques au coeur des vos thématiques d'intérêt par une approche multi-omique.

Experience

CEA

Biotechnology

Analyse de données multi-omiques

Grenoble, France

October 2016 - December 2019

Proteomic analysis of histone post-translational modifications (focus on acetylation and crotonylation) during mouse spermatogenesis
Metabolomic analyses of acyl-CoA (substrates of acylations) in mouse testis cells
Genomic analysis (ChIP-seq) of crotonylation in spermatocytes and round spermatids
- Implementation of bioinformatics pipelines for quality control, mapping and peak calling of ChIP-seq datasets: Fastqc, Seqtk, Trimmomatic, Bowtie2, Picard tool, Macs2 – Bash programming
- Writing of R scripts and usage of bedtools commands in Unix for genomics data analysis
- Integration with public ChIP-seq data such as H3K4me1 for enhancers, H3K4me3 for active transcription and transcription factors or regulators
Transcriptomic analysis of RNA expression in spermatocytes and round spermatids
Programming with Bash, R and Python (3 years)
Biostatistical analysis of genomic and transcriptomic data
Three projects realized in collaboration with research teams

Education

Certifications

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