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- Mario CANOCours de Python, R et Linux-Ubuntu orientés vers les SciencesEDUCATION AND E-LEARNINGJanuary 2016 - Today (10 years and 5 months)Paris, France-Je donne des cours de Python et R dans les environnent Windows et Linux-Ubuntu (tout niveau).-J'aide notamment dans la réalisation de projets informatique orientés vers la Bio-informatique Structurale, Bio-statistique, ainsi que de projets orientés vers le domaine numérique : l’utilisation de ces langages en Maths et Physique-Chimie.
- MTi, Inserm UMR-S973, Université Paris Diderot (Maintenant Université Paris Cité)Projet: Inhibition de la protéase de VIH-2: Etude des mécanismes de résistance par des approches de bioinformatique structurale et recherche de nouveaux inhibiteurs spécifiques (VIH2-Bioinfo)RESEARCHMarch 2015 - December 2015 (10 months)Paris, FranceIngénieur de recherche.-Mise en place des jeux de données pour la comparaison structurales des protéasesdu VIH de type 1 et de type 2, ainsi que de leur inhibiteurs.-La comparaison des sites de liaisons des inhibiteurs des protéases du VIH de type 1 et de type 2, utilisant les langages R et Python.-Développement des modelés QSAR (Quantitative structure-activity relationship ) afin de prédire l'activité des inhibiteurs vers les protéases du VIH de type 1 et de type 2. Pour développer ces modelés j’étais responsable de l’application des méthodes supervisées de machine Learning, comme Régression linéaire, Radom Forest et SVM (Support vector machine), utilisant toujours les langages Python et R dans l'environnement Linux-Ubuntu.
- CNRS UMR 9187 – Inserm U1196 Institut Curie – Centre de rechercheProjet: Les mouvements du microtubule en dépolymérisation étudiés par les modes normaux à partir des coordonnées atomiques et des images de microscopie électroniqueRESEARCHJanuary 2014 - June 2014 (6 months)Orsay, France-J’étais responsable de développer une nouvelle méthode, en utilisant le langage de programmation C, pour calculer les modes normaux de vibration (une propriété des systèmes biologiques) d’un microtubule, à partir des images obtenues par microscopie électronique, sans utiliser les coordonnées atomiques.-Faire la comparaison des résultats des modes normaux obtenus appliquant la méthode avec les valeurs théoriques.-Le but de ce projet c’était de réduire le temps de calcul des modes normaux obtenus en prenant en considérations les coordonnées atomiques.
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