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Mario CanoMC

Mario Cano

Bio-informaticien - Développeur: Python, R

On-demand
Paris, FR
3-7 years

Average response time: 1 hour

About Mario

Bonjour, moi c’est Mario, je suis développeur des langages Python, R et C dans les environnements Linux-Ubuntu et Microsoft Windows. J’ai de l’expérience dans la utilisation de ces langages dans l’application de méthodes de Machine Learning au développement des médicaments et de l’aide dans la réalisation de projets orientés vers les sciences aux étudiants de licence et master, mais les connaissances que j’ai acquis, peuvent s’appliquer à n’importe quelle domaine.
Ici, je fais un résumé des projets que j’ai réalisé.

J’ai travaillé à l’INSERM, dans un projet où nous avons développé différents modelés statistiques afin de prédire quelles molécules (inhibiteurs) sont actives sur la PR2 (protéine du VIH). Ces modelés nous les avons développés en nous basant sur les différentes propriétés de chaque inhibiteur. Nous avons créés une base de données avec le nom de chaque inhibiteur et chaque propriété (quantitative), puis en utilisant les différentes méthodes d’analyse supervisées (méthodes statistiques) dans les langages R, nous avons obtenus différents modelés (des équations mathématiques où les variables sont les propriétés le plus percutante) qui nous permettaient déterminer quels inhibiteurs étaient plus actif contre la cible.
J’ai aussi travaillé dans un projet où à partir d’une base de données des fichiers PDB (fichiers où nous trouvons les coordonnées atomiques d’une protéine), nous avons extrait, en utilisant le langage Python, des informations du fichier PDB pour chaque protéine afin de déterminer différentes propriétés physiques de chacune.

J’ai travaillé dans projet à l’Institut Curie, où nous avons prédit les mouvements d’un système biologique, en utilisant le langage C, à partir des images obtenues par microscopie électronique et non à partir de coordonnées atomiques. Pour développer ce modèle nous avons considérés, chaque pixel de l’image comme une coordonnée atomique.

N’hésitez pas à me contacter pour me proposer des missions.
  • French

    Native or bilingual

  • Spanish

    Native or bilingual

  • English

    Fluent

Can work on-site
Paris (up to 20km)

Experience

  • Mario CANO
    Cours de Python, R et Linux-Ubuntu orientés vers les Sciences
    EDUCATION AND E-LEARNING
    January 2016 - Today (10 years and 5 months)
    Paris, France
    -Je donne des cours de Python et R dans les environnent Windows et Linux-Ubuntu (tout niveau).
    -J'aide notamment dans la réalisation de projets informatique orientés vers la Bio-informatique Structurale, Bio-statistique, ainsi que de projets orientés vers le domaine numérique : l’utilisation de ces langages en Maths et Physique-Chimie.
    Python (Programming Language) langage R Anaconda Linux-Ubuntu Windows Mathématiques appliquées Physique Chimie
  • MTi, Inserm UMR-S973, Université Paris Diderot (Maintenant Université Paris Cité)
    Projet: Inhibition de la protéase de VIH-2: Etude des mécanismes de résistance par des approches de bioinformatique structurale et recherche de nouveaux inhibiteurs spécifiques (VIH2-Bioinfo)
    RESEARCH
    March 2015 - December 2015 (10 months)
    Paris, France
    Ingénieur de recherche.
    -Mise en place des jeux de données pour la comparaison structurales des protéases
    du VIH de type 1 et de type 2, ainsi que de leur inhibiteurs.
    -La comparaison des sites de liaisons des inhibiteurs des protéases du VIH de type 1 et de type 2, utilisant les langages R et Python.
    -Développement des modelés QSAR (Quantitative structure-activity relationship ) afin de prédire l'activité des inhibiteurs vers les protéases du VIH de type 1 et de type 2. Pour développer ces modelés j’étais responsable de l’application des méthodes supervisées de machine Learning, comme Régression linéaire, Radom Forest et SVM (Support vector machine), utilisant toujours les langages Python et R dans l'environnement Linux-Ubuntu.
    Python (Programming Language) Langage R Machine learning
  • CNRS UMR 9187 – Inserm U1196 Institut Curie – Centre de recherche
    Projet: Les mouvements du microtubule en dépolymérisation étudiés par les modes normaux à partir des coordonnées atomiques et des images de microscopie électronique
    RESEARCH
    January 2014 - June 2014 (6 months)
    Orsay, France
    -J’étais responsable de développer une nouvelle méthode, en utilisant le langage de programmation C, pour calculer les modes normaux de vibration (une propriété des systèmes biologiques) d’un microtubule, à partir des images obtenues par microscopie électronique, sans utiliser les coordonnées atomiques.
    -Faire la comparaison des résultats des modes normaux obtenus appliquant la méthode avec les valeurs théoriques.
    -Le but de ce projet c’était de réduire le temps de calcul des modes normaux obtenus en prenant en considérations les coordonnées atomiques.
    Langage C Linux Modélisation 3D

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