About Gladis
Data Scientist | IA santé | Visualisation médicale
Contrôle qualité | Normalisation dataset | Appui recherche clinique
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- Institut du Cancer MontpelliérainCDI Data ScientistHEALTH AND WELLNESSSeptember 2023 - Today (2 years and 9 months)Montpellier, FranceL’Institut du Cancer de Montpellier souhaitait structurer et exploiter des volumes importants de données cliniques, trop souvent sous-utilisées.Les équipes médicales manquent d’outils de visualisation et d’analyse pour appuyer leurs décisions, notamment dans des contextes critiques comme la chirurgie du cancer du rectum.Le projet est encore en phase de prototypage. Les premiers tests visent à évaluer l’impact sur le temps médical et la fluidité du parcours patient.Actions menées :- Structuration des bases, normalisation des flux, documentation des données de recherches- Accompagnement des doctorants dans l’analyse et l’interprétation des données issues des études cliniques- Conception d’un tableau de bord interactif pour rendre les résultats des études immédiatement exploitables par les chercheurs- Développement d’un module d’aide à la décision pour les chirurgiens, visant à générer automatiquement les mesures-clés à partir des IRM- Intégration de briques de détection et de segmentation des tumeurs pour réduire les délais entre diagnostic et planification opératoire
- Institut du Cancer MontpelliérainCDD Ingénieur RechercheHEALTH AND WELLNESSMarch 2023 - August 2023 (5 months)Montpellier, FranceL’ICM mène un projet de recherche sur le cancer du pancréas, où les signes cliniques apparaissent souvent à un stade déjà avancé.Avec l’arrivée d’une nouvelle technologie de radiothérapie guidée par IRM, le besoin était d’anticiper les risques de récidive et d’adapter les protocoles thérapeutiques.J’ai été sollicitée pour contribuer à la thèse d’un médecin, centrée sur le développement de modèles pronostiques.Actions menées :- Extraction de données cliniques et radiomiques à partir d’imageries médicales (conversion en formats tabulaires exploitables)- Constitution d’un jeu de données multiparamétriques à partir d’une cohorte de patients traités- Analyse statistique visant à identifier des marqueurs précoces de survie et de récidive- Transmission régulière des résultats au médecin-chercheur pour alimenter la modélisation- Travail autonome sur l’ensemble du pipeline, de la donnée brute à l’analyse👉 Résultats obtenus :- Premiers résultats permettant de stratifier les patients selon leur niveau de risque (faible ou élevé), ouvrant la voie à une personnalisation des décisions thérapeutiques- Le projet est toujours en cours, dans le cadre de la thèse intitulée "Développement de modèles pronostiques multiparamétriques dans la radiothérapie stéréotaxique guidée par IRM des cancers du pancréas"
- Nurea SoftStage Ingénieur RechercheHEALTH AND WELLNESSApril 2022 - September 2022 (5 months)Bordeaux, FranceNurea développe des solutions d’imagerie médicale pour sécuriser le suivi post-opératoire des patients atteints d’anévrisme de l’aorte.L’équipe avait besoin d’un modèle fiable pour assister les médecins dans la détection des endofuites sur scanner, une complication pouvant entraîner une rupture de l’aorte.Je suis intervenue pour bâtir une base d’apprentissage pour permettre l’automatisation de cette détection critique.Actions menées :- Constitution d’un dataset exploitable à partir d’imageries médicales segmentées manuellement- Entraînement et évaluation d’un modèle de détection d’endofuites, avec revue régulière des performances par le CEO (profil médical)- Amélioration continue du modèle via une boucle d’analyse d’erreurs et de réflexion sur les cas limites- Définition de critères de décision pertinents pour un usage en appui au diagnostic médical- Visualisation des résultats pour en faciliter l’interprétation par les équipes hospitalières👉 Résultats obtenus :- Prototype validé avec 95 % de sensibilité et 94 % de spécificité- Amélioration du suivi post-opératoire, avec un outil désormais intégré à l’offre Nurea et utilisé dans les CHU de Bordeaux et Lyon- Premiers retours positifs des médecins utilisateurs, confirmant la pertinence de l’approche
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- Machine Learning EngineerData Scientest2023En partenariat avec les MINES PariTech | PSL Executive Education RNCP niveau 7 (Bac +5) - 36129 « Chef de projet en intelligence artificielle » Projet fil rouge : Kidney Tumor Segmentation 2021 Segmentation automatique des reins, des tumeurs et des kystes sur des imageries médicales (scanner) Compétences acquises sur le parcours Data Scientist : Machine Learning Supervisé, Non Supervisé et Avancé ; Big Data et Data Base ; Deep Learning ; Système complexe et IA Compétences acquises sur le parcours MLOps : Programmation avancée (Bash, Git, Tests Unitaires) ; DataOps - Isolation (FastAPI, sécurisation des API, Docker, Bootstraps) ; DataOps - Orchestration (Kubernetes, Airflow) ; ModelOps (MLFlow et acculturation Data).
- Data AnalystOpen Classrooms2022En partenariat avec l’ENSAE-ENSAI Titre RNCP niveau 6 - 34964 Compétences acquises : Analyse exploratoire des données, Data Visualisation, Requêtes SQL, Tests statistiques, Réduction de dimension (ACP), Clustering (KMeans), Classification (Régression Logistique), Séries Temporelles.
Certifications
- Machine Learning EngineeringData Scientest2023